More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  89.52 
 
 
249 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  47.5 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  41.42 
 
 
252 aa  204  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  41.98 
 
 
246 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  46.25 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  43.21 
 
 
250 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  41.67 
 
 
253 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  43.98 
 
 
256 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  43.33 
 
 
254 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  43.67 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
256 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
264 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
256 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  42 
 
 
255 aa  174  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 
255 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  40 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  40.08 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
249 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
246 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  37.55 
 
 
250 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
253 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
250 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  34.43 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.09 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.62 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  42.14 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  32.93 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.82 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  26.47 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  35.51 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  31.82 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  32 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.4 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.79 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  27.42 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.8 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  30.47 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  30.47 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.61 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  27.61 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  27.61 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.61 
 
 
258 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.61 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.61 
 
 
258 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  32.1 
 
 
254 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.61 
 
 
261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.69 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  28.47 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
328 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.41 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>