More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06881 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  82.55 
 
 		 426 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  81.41 
 
 		 426 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  81.88 
 
 		 426 aa  716    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 435 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 428 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 422 aa  348  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 425 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 422 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 422 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.07 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 450 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 419 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>