More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  100 
 
 		 341 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  77.74 
 
 		 301 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  74.18 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  57.38 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  57.14 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  56.72 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  50.66 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  49.67 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  48.52 
 
 		 306 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  48.52 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  49.84 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.56 
 
 		 310 aa  298  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.54 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.55 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.93 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.9 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.43 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  39.69 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  29.11 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  29.11 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  28.17 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  37.86 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  36.89 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  36.89 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  36.27 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  36.27 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.24 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.81 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  36.89 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.66 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  35.29 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  35.29 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.42 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.42 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  26.98 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  26.21 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.42 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  24.85 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.64 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  24.84 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.27 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  22.4 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  30.63 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.23 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.32 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  25.74 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>