More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10831 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  996    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  71.48 
 
 
518 aa  704    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  38.23 
 
 
525 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  38.23 
 
 
518 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.62 
 
 
531 aa  286  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 
539 aa  276  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  37.26 
 
 
539 aa  276  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 
528 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  36.77 
 
 
528 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 
546 aa  273  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 
539 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
539 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  35.27 
 
 
535 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  35.55 
 
 
533 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  34.19 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 
541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 
544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  32.49 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 
576 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.48 
 
 
560 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 
537 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 
533 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  32.3 
 
 
542 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.27 
 
 
560 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  31.17 
 
 
521 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
532 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 
530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  32.35 
 
 
543 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  31.76 
 
 
533 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  31.76 
 
 
533 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  31.76 
 
 
533 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  33.99 
 
 
516 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 
532 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  32.07 
 
 
532 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  31.36 
 
 
533 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  29.2 
 
 
528 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 
555 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  31.49 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  31.49 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  28.97 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  31.49 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  31.49 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  31.24 
 
 
517 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 
529 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 
543 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 
530 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
532 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
532 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
532 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
545 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
545 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  29.48 
 
 
541 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  30.51 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  31.83 
 
 
541 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 
522 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  31.52 
 
 
541 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  31.52 
 
 
664 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 
541 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  32.12 
 
 
530 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 
541 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.28 
 
 
666 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 
543 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 
536 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  34.27 
 
 
630 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 
635 aa  206  6e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 
537 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  31.59 
 
 
537 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  31.59 
 
 
537 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 
614 aa  200  6e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 
616 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30.33 
 
 
519 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.33 
 
 
642 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.33 
 
 
642 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  31.9 
 
 
528 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 
521 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  26.46 
 
 
491 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 
647 aa  170  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 
576 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
467 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.56 
 
 
467 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.56 
 
 
467 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.32 
 
 
467 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 
539 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.32 
 
 
467 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.32 
 
 
467 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
467 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.32 
 
 
467 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.32 
 
 
467 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.85 
 
 
467 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.85 
 
 
467 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 
475 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.88 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>