More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04351 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  77.99 
 
 
262 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  77.22 
 
 
262 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  67.69 
 
 
261 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  62.3 
 
 
263 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  62.3 
 
 
263 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  56.47 
 
 
264 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  55.69 
 
 
264 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  55.29 
 
 
264 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  54.23 
 
 
264 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  54.51 
 
 
273 aa  299  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  54.47 
 
 
270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  54.3 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  54.09 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  57.75 
 
 
281 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  51.94 
 
 
261 aa  278  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  52.55 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  52.55 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  43.58 
 
 
268 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.4 
 
 
461 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  44.79 
 
 
259 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  46.51 
 
 
261 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  41.83 
 
 
462 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.31 
 
 
457 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  45.38 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.55 
 
 
606 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.63 
 
 
458 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  46.09 
 
 
261 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  37.35 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.7 
 
 
462 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.86 
 
 
458 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 
271 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.92 
 
 
264 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 
257 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 
257 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.45 
 
 
257 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  41.6 
 
 
258 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  39 
 
 
255 aa  185  9e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.15 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.15 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.15 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.15 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  43.58 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
263 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  39.77 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  39.53 
 
 
254 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.77 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.77 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.77 
 
 
255 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.77 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  42.47 
 
 
257 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.52 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 
260 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.77 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.16 
 
 
464 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  41.51 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  35.55 
 
 
260 aa  178  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 
262 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
271 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39.16 
 
 
262 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 
256 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.96 
 
 
256 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  38.61 
 
 
265 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  42.69 
 
 
258 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 
258 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.77 
 
 
256 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  40.62 
 
 
265 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 
258 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  41.54 
 
 
267 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.74 
 
 
256 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  37.98 
 
 
253 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.39 
 
 
255 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  43.73 
 
 
261 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.74 
 
 
256 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 
263 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.16 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  42.21 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.61 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  44.36 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  44.36 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  41.86 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  43.73 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.93 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  41.89 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  39.3 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  39.7 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  42.02 
 
 
266 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  41.63 
 
 
273 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  39.85 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.61 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  37.98 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  39.62 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>