226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01571 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 		 144 aa  291  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  73.94 
 
 		 143 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  72.54 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  69.13 
 
 		 147 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  68.71 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  68.06 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  60.56 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  61.97 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  61.97 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  60.56 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  43.75 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  40.91 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  35.12 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  34.42 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  34.42 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  33.99 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  40.7 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.78 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  37.21 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.99 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  34.02 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  37.35 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  33.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.83 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.48 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  39.29 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  31.18 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  34.21 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.48 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  39.73 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  39.47 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.55 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  35.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  40.28 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  30.95 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32.97 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32.97 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  32.93 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  31.91 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  34.88 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.67 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  36.26 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>