More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2941 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
696 aa  1374    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.7 
 
 
754 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.12 
 
 
1559 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  50.59 
 
 
531 aa  360  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.57 
 
 
1085 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.2 
 
 
716 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.36 
 
 
689 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
701 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 
773 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 
806 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
657 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
882 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
657 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1965 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  47.09 
 
 
573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1287 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
663 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 
745 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
652 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
720 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
889 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
735 aa  266  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
865 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
955 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1184 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1297 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
1478 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
519 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
1557 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
1431 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 
934 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 
1419 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
680 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1068 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
1548 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 
1808 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1391 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 
796 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1331 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.99 
 
 
1399 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
1330 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
708 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1501 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  39.07 
 
 
725 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
678 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
824 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
631 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
1002 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  38.99 
 
 
678 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
947 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
585 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.31 
 
 
1371 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
628 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
816 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.59 
 
 
1214 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
697 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
587 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.53 
 
 
676 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
653 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.12 
 
 
1407 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.16 
 
 
1220 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
962 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.24 
 
 
1380 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
794 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
794 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  37.27 
 
 
1384 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
696 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.5 
 
 
1361 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  35.5 
 
 
1131 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1223 aa  211  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1222 aa  208  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  41.38 
 
 
459 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
730 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  37.22 
 
 
742 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
666 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
666 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
781 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  37.91 
 
 
769 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
664 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
654 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
771 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
771 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
771 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
703 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
771 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
772 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
771 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
866 aa  200  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
663 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  32.56 
 
 
908 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
660 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
835 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
799 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
1084 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
526 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1177 aa  196  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>