More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3395 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  297  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 171 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 191 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  36.89 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  42.86 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  38.69 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  36.5 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.77 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  30.72 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.85 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  36.44 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  34.75 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  34.75 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  34.75 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.88 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  32.12 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  36.44 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  36.52 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  35.65 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.95 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  32.59 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  33.58 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>