224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9858 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  43.48 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  40.22 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12366  predicted protein  39.33 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  40.26 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  40.26 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  38.04 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  41.56 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 
222 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  39.53 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  36.9 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.9 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  42.31 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  37.21 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  37.65 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  36.26 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  36.26 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.9 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  37.35 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  38.27 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 
245 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  38.75 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  37.5 
 
 
222 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  35.37 
 
 
524 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  38.04 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  36.25 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.78 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  35.8 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.78 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  39.44 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  41.33 
 
 
870 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
203 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  38.75 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  37.35 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  37.35 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  29.67 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  44.29 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  40.28 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  37.18 
 
 
552 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35.29 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.27 
 
 
441 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  40.62 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.87 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  35.8 
 
 
694 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  31.87 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  31.33 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  32.93 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  31.25 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  35 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  36.25 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  30.68 
 
 
114 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  31.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  27.38 
 
 
90 aa  52  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
207 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  27.38 
 
 
90 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>