More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5068 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_5068  predicted protein  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0695806  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  45.76 
 
 
924 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  44.35 
 
 
903 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  46.19 
 
 
932 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  46.19 
 
 
932 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  46.35 
 
 
929 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  46.19 
 
 
932 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  47.98 
 
 
929 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  41.74 
 
 
903 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  45.41 
 
 
931 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  44.98 
 
 
928 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  46.19 
 
 
930 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  44.1 
 
 
928 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  42.49 
 
 
951 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  44.1 
 
 
928 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  44.1 
 
 
928 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  44.1 
 
 
928 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  44.1 
 
 
928 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  39.13 
 
 
299 aa  178  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  42.61 
 
 
912 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  40.09 
 
 
949 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.3 
 
 
896 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  42.73 
 
 
918 aa  174  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  42.73 
 
 
922 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  42.29 
 
 
921 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  44.1 
 
 
930 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  43.24 
 
 
922 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  42.06 
 
 
988 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  44.39 
 
 
928 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  42.55 
 
 
906 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  42.29 
 
 
922 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  42.29 
 
 
922 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  42.29 
 
 
922 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  41.63 
 
 
956 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  42.61 
 
 
935 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  43.5 
 
 
928 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  42.61 
 
 
921 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.3 
 
 
896 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  42.61 
 
 
921 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.17 
 
 
943 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  42.61 
 
 
921 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  43.69 
 
 
918 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.63 
 
 
939 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  42.86 
 
 
938 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  42.41 
 
 
930 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  39.57 
 
 
982 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  37.99 
 
 
933 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  43.05 
 
 
934 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  43.24 
 
 
945 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  37.12 
 
 
936 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.36 
 
 
956 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  43.69 
 
 
933 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  45.89 
 
 
934 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  39.13 
 
 
943 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  39.74 
 
 
910 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  42.34 
 
 
923 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  42.13 
 
 
1022 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  37.12 
 
 
924 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.03 
 
 
891 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  38.7 
 
 
923 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  39.15 
 
 
945 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  39.39 
 
 
1024 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  38.1 
 
 
937 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.77 
 
 
939 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  41.96 
 
 
934 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  38.7 
 
 
923 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  38.43 
 
 
942 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  38.72 
 
 
876 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  37.99 
 
 
941 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.96 
 
 
946 aa  161  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  37.24 
 
 
963 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.13 
 
 
936 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  38.84 
 
 
945 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.01 
 
 
936 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.06 
 
 
902 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.13 
 
 
908 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.5 
 
 
932 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  38.63 
 
 
905 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.1 
 
 
939 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  40.87 
 
 
911 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  36.32 
 
 
926 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  39.41 
 
 
929 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  38.82 
 
 
953 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.36 
 
 
946 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  38.03 
 
 
877 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.45 
 
 
902 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.83 
 
 
892 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.45 
 
 
902 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  36.96 
 
 
926 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  39.15 
 
 
876 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  37.83 
 
 
917 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.63 
 
 
893 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>