More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45076 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  53.98 
 
 
684 aa  748    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  54.7 
 
 
751 aa  747    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  55.22 
 
 
682 aa  758    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  47.94 
 
 
701 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  100 
 
 
710 aa  1488    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.02 
 
 
678 aa  600  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  45.75 
 
 
672 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  45.16 
 
 
684 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.6 
 
 
647 aa  572  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  43.54 
 
 
654 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.86 
 
 
662 aa  524  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.93 
 
 
668 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  33.58 
 
 
679 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.16 
 
 
639 aa  197  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.96 
 
 
668 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27 
 
 
633 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  27.7 
 
 
741 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  26.73 
 
 
642 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.67 
 
 
731 aa  187  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  25.76 
 
 
1240 aa  186  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.97 
 
 
841 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  26.64 
 
 
737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.57 
 
 
747 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.32 
 
 
737 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.63 
 
 
659 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  26.54 
 
 
729 aa  184  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.76 
 
 
822 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.29 
 
 
742 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  27.74 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  27.22 
 
 
740 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  27.78 
 
 
742 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  27.02 
 
 
748 aa  180  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.94 
 
 
731 aa  180  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  26.52 
 
 
728 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  25.89 
 
 
1224 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.79 
 
 
770 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.2 
 
 
768 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  26.67 
 
 
759 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.75 
 
 
1320 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  26.67 
 
 
759 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 
749 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.04 
 
 
636 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  24.81 
 
 
634 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  26.26 
 
 
659 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  26.67 
 
 
759 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  26.72 
 
 
834 aa  177  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  26.08 
 
 
730 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  26.25 
 
 
659 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  24.65 
 
 
680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  26.55 
 
 
749 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  25.23 
 
 
749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.48 
 
 
729 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.34 
 
 
631 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  26.76 
 
 
728 aa  173  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 
722 aa  173  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  26.54 
 
 
738 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  26.6 
 
 
728 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.31 
 
 
741 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.48 
 
 
732 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.36 
 
 
646 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  31.06 
 
 
740 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 
728 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  24.88 
 
 
725 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.48 
 
 
735 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  26.85 
 
 
728 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  26.85 
 
 
728 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.19 
 
 
784 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  25.61 
 
 
766 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  27.11 
 
 
743 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.34 
 
 
728 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  26.85 
 
 
728 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  25.9 
 
 
733 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.36 
 
 
807 aa  171  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  26.28 
 
 
727 aa  171  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  27.11 
 
 
743 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  25.84 
 
 
728 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  26.85 
 
 
728 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  26.12 
 
 
727 aa  171  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  27.3 
 
 
743 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  26.12 
 
 
727 aa  171  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  26.69 
 
 
728 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  24.45 
 
 
735 aa  170  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  24.88 
 
 
732 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.5 
 
 
784 aa  170  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.35 
 
 
776 aa  170  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  26.51 
 
 
726 aa  170  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  25.04 
 
 
763 aa  170  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  25.08 
 
 
736 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  25.83 
 
 
765 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  24.82 
 
 
756 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  26.44 
 
 
728 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.95 
 
 
732 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  30.65 
 
 
725 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  27.45 
 
 
677 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.15 
 
 
785 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>