58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1493 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  100 
 
 		 437 aa  894    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  37.26 
 
 		 590 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  34.69 
 
 		 756 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  39.76 
 
 		 815 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  40.74 
 
 		 701 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  39.53 
 
 		 738 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.05 
 
 		 732 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  45.45 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  29.33 
 
 		 868 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  29.33 
 
 		 868 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  29.33 
 
 		 868 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  29.74 
 
 		 867 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  39.08 
 
 		 880 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  45.1 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  40.23 
 
 		 725 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  51.16 
 
 		 930 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  63.49 
 
 		 665 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  54.79 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  27.05 
 
 		 716 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  28 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2048  fec I like protein  100 
 
 		 164 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  30.57 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.91 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  37.86 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.8 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  33.04 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  32.2 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  28.06 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1776 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  25.82 
 
 		 720 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  35.51 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  33.78 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.83 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  26.83 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  26 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  40 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  30.67 
 
 		 278 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  24.92 
 
 		 654 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  30.24 
 
 		 979 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  31.29 
 
 		 717 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  30.43 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.5 
 
 		 681 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  26.9 
 
 		 609 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  27.4 
 
 		 679 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  29.22 
 
 		 847 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  36.99 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.5 
 
 		 681 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  26.12 
 
 		 895 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  29.22 
 
 		 834 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  33.75 
 
 		 362 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  37 
 
 		 759 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0154  hypothetical protein  27.17 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00000684092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  27.38 
 
 		 617 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  27.68 
 
 		 1051 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  27.45 
 
 		 718 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>