68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0154 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  680    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00000684092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  24.03 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  25.69 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  24.03 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  26.6 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  25.71 
 
 		 539 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  30 
 
 		 530 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.37 
 
 		 828 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  24.92 
 
 		 535 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  25.47 
 
 		 560 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  22.19 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  21.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  21.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  21.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  21.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  21.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  21.1 
 
 		 584 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  22.02 
 
 		 579 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  20.96 
 
 		 574 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  21.47 
 
 		 601 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  20.14 
 
 		 614 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  21.43 
 
 		 600 aa  48.1  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  20.13 
 
 		 565 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  22.12 
 
 		 637 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  21.05 
 
 		 645 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  27.66 
 
 		 738 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  23.2 
 
 		 586 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  23.74 
 
 		 577 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  23.4 
 
 		 579 aa  46.2  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  21.17 
 
 		 575 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  23.05 
 
 		 599 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  21.88 
 
 		 617 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  21.74 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  22.51 
 
 		 576 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  18.29 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  24.28 
 
 		 546 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  22.8 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1533  TOPRIM domain-containing protein  31.88 
 
 		 682 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100507 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  21.4 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  27.17 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  21.4 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  20.25 
 
 		 581 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  24.2 
 
 		 614 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25 
 
 		 815 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  27.5 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  24.2 
 
 		 605 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  20.66 
 
 		 609 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  24.2 
 
 		 605 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  21.82 
 
 		 652 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  22.87 
 
 		 595 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  21.19 
 
 		 574 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  19.43 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  22.87 
 
 		 595 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  19.78 
 
 		 564 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  21.57 
 
 		 636 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  20.44 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  20.99 
 
 		 581 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 604 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  20.64 
 
 		 576 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  26.9 
 
 		 651 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  28.57 
 
 		 677 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>