15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1963 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1963  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2656  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  297  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1297  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  296  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.382928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2772  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  296  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.279458  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2848  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  296  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.357986  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1233  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.541104  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2608  hypothetical protein  77.98 
 
 
300 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.845051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2077  hypothetical protein  76.05 
 
 
300 aa  291  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240996  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3235  hypothetical protein  78.57 
 
 
301 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0158145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2643  hypothetical protein  64.71 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0835  hypothetical protein  64.12 
 
 
290 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3226  hypothetical protein  60.59 
 
 
281 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0590  hypothetical protein  52.66 
 
 
273 aa  178  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2048  fec I like protein  100 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  87.76 
 
 
437 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>