13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2608 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2608  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  624  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.845051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1297  hypothetical protein  97.67 
 
 
300 aa  613  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.382928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2656  hypothetical protein  98 
 
 
300 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2772  hypothetical protein  98 
 
 
300 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.279458  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2848  hypothetical protein  98 
 
 
300 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.357986  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2077  hypothetical protein  96.67 
 
 
300 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240996  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1233  hypothetical protein  94.67 
 
 
300 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.541104  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3235  hypothetical protein  71.81 
 
 
301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0158145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3226  hypothetical protein  61.24 
 
 
281 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2643  hypothetical protein  61.39 
 
 
272 aa  341  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0835  hypothetical protein  59.64 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0590  hypothetical protein  55.38 
 
 
273 aa  300  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1963  hypothetical protein  77.98 
 
 
212 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>