13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3235 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3235  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0158145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1297  hypothetical protein  71.48 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2608  hypothetical protein  71.81 
 
 		 300 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.845051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2656  hypothetical protein  71.48 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2772  hypothetical protein  71.48 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.279458  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2848  hypothetical protein  71.48 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.357986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1233  hypothetical protein  73.38 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.541104  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2077  hypothetical protein  70.47 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240996  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2643  hypothetical protein  67.42 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0835  hypothetical protein  64.86 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3226  hypothetical protein  65.52 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1963  hypothetical protein  78.57 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0590  hypothetical protein  49.81 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>