71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2816 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2816  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
612 aa  1239    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.8 
 
 
487 aa  326  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3063  NHL repeat containing protein  40.13 
 
 
488 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440395 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3061  NHL repeat containing protein  38.57 
 
 
433 aa  280  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7910  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.13 
 
 
525 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1618  hypothetical protein  28.87 
 
 
428 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0613735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1899  hypothetical protein  28.87 
 
 
428 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.11 
 
 
546 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2153  hypothetical protein  29.35 
 
 
148 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 
435 aa  53.9  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 
465 aa  53.9  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.88 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
454 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
448 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  36.78 
 
 
446 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  31.45 
 
 
396 aa  50.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  40.28 
 
 
525 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  35.23 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 
446 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  50 
 
 
446 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.89 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.17 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0171  hypothetical membrane spanning protein  30.56 
 
 
148 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  43.66 
 
 
440 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5070  NHL repeat containing protein  22.04 
 
 
417 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.44 
 
 
433 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
429 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  44.83 
 
 
448 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 
437 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2091  hypothetical protein  29.91 
 
 
142 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  24.76 
 
 
408 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
429 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  31.97 
 
 
460 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  33.06 
 
 
438 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  31.91 
 
 
447 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  22.43 
 
 
423 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 
447 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  23.58 
 
 
363 aa  47.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  38.57 
 
 
445 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  28.7 
 
 
448 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  25.69 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  37.5 
 
 
485 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  24.42 
 
 
363 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  27.31 
 
 
447 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  37.5 
 
 
514 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  36.9 
 
 
446 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  34.88 
 
 
442 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  25.43 
 
 
442 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.07 
 
 
448 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  27.44 
 
 
447 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  36.11 
 
 
429 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  26.24 
 
 
461 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  26.03 
 
 
438 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.36 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.36 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2102  hypothetical protein  28.04 
 
 
142 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  22.32 
 
 
430 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4079  conserved hypothetical membrane spanning protein  28.41 
 
 
149 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.11 
 
 
438 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.82 
 
 
451 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
429 aa  44.3  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.91 
 
 
587 aa  44.3  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  34.62 
 
 
439 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 
421 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.95 
 
 
420 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  30.1 
 
 
422 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  33 
 
 
448 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.93 
 
 
388 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
473 aa  43.5  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>