219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2542 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  52.86 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  31.51 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  46.94 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  35.44 
 
 		 410 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.91 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  31.17 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.25 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  29.87 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 190 aa  43.9  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  27.42 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  40 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  35 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  27.42 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.26 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  28.36 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>