More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0669 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  893    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  45.83 
 
 
418 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 
430 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 
432 aa  333  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.23 
 
 
428 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 
424 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 
428 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  41.29 
 
 
431 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 
436 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 
432 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 
436 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 
436 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 
445 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.28 
 
 
435 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 
439 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
436 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 
431 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.14 
 
 
431 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 
431 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 
431 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 
436 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.14 
 
 
431 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.14 
 
 
431 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 
417 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 
417 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 
438 aa  286  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 
431 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 
414 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
432 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 
431 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 
429 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 
443 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 
442 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
432 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 
438 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 
442 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 
432 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 
433 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  40.58 
 
 
417 aa  280  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
443 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 
442 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.68 
 
 
439 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 
443 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 
442 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 
438 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
431 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  36.3 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 
438 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
429 aa  274  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 
429 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 
438 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 
469 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 
428 aa  272  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 
436 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 
428 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  35.27 
 
 
437 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 
429 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  39.28 
 
 
431 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 
431 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 
439 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
431 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
431 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 
436 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 
425 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  37 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  33.18 
 
 
441 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
433 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
431 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
431 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 
434 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 
440 aa  265  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 
436 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  34.27 
 
 
448 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 
428 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 
437 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 
440 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 
440 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 
431 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  34.79 
 
 
428 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>