226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4432 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 200 aa  377  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  56.19 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.08 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.45 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  58.62 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.95 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  52.79 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.85 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.38 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  57.36 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  45.13 
 
 		 202 aa  171  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  51.27 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  51.3 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  51.3 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  51.3 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  51.5 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  45.79 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  48.74 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.89 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  50.77 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  48.54 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.08 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  47.64 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  46.7 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.44 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.44 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  46.39 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.4 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.26 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.23 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  46.32 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  48.95 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  48.45 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  51.79 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  45.27 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  41.27 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  47.59 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.24 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.77 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.15 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  39.9 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  49.48 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  43.43 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  43.94 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  42 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.37 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  50.25 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  43.78 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  48.74 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  48.48 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  43.59 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43.94 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.88 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2383  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.26 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  46.97 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  43.68 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  41 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  48.56 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  40.61 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.96 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  46.53 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  41.5 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.59 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.42 
 
 		 206 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  43.75 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  50.49 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  40 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  39.5 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  43.23 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  40 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  39.5 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>