54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2658 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  100 
 
 
381 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.97 
 
 
420 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.78 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  29.52 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  29.12 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  31.16 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.74 
 
 
543 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  29.75 
 
 
446 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.94 
 
 
435 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  24.21 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  27.22 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  25.67 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
504 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  27.24 
 
 
484 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  22.52 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.55 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  29.39 
 
 
486 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.56 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
477 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
474 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
473 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.93 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0547  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0671651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0533  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  25.5 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  26.12 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.92 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
474 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.27 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.27 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  25.8 
 
 
364 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.55 
 
 
381 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.93 
 
 
491 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  27.4 
 
 
486 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.74 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.92 
 
 
444 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.64 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
499 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  26.21 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.38 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  27.37 
 
 
493 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  25.21 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1733  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.87 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  28.17 
 
 
504 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.1 
 
 
441 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  24.71 
 
 
488 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  26.49 
 
 
486 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1610  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>