65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1524 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 171 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  53.76 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  52.02 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  53.8 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  48.07 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  49.4 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  50.9 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  47.88 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  49.29 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  43.67 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  43.67 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  36.31 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  39.67 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.95 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.54 
 
 		 548 aa  51.6  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  29.01 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  29.22 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 		 173 aa  44.7  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  22.58 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  28.23 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>