More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0581 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 517 aa  1056    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 517 aa  1056    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12180  transposase  63.2 
 
 		 488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  56.3 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  33.48 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4006  integrase catalytic subunit  59.84 
 
 		 152 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.031908  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  32.87 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  32.87 
 
 		 416 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  31.18 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  31.18 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  31.18 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  31.41 
 
 		 610 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  29.53 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 509 aa  93.6  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 509 aa  93.6  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  29.63 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  27.83 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  27.83 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  27.83 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  27.79 
 
 		 428 aa  90.5  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  27.44 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  29.58 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  29.58 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  28.16 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  28.16 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  29.57 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  29.57 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  29.48 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  24.04 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  28.89 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  28.89 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  28.89 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  25.96 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  25.96 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  25.96 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  25.96 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  26.84 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  29.86 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  26.21 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  26.78 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  27.2 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03420  transposase  30.36 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  27.03 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  27.03 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  27.03 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  26.81 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  28.63 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  26.27 
 
 		 517 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  27.41 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  27.41 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 306 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 496 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>