More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0878 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  59.93 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  59.93 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 		 280 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  58.16 
 
 		 282 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  58.48 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 283 aa  321  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  57.6 
 
 		 283 aa  321  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 274 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  56.36 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  57.65 
 
 		 281 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  56.63 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  54.42 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  55.43 
 
 		 283 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  51.75 
 
 		 282 aa  271  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  54.31 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.54 
 
 		 286 aa  241  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.1 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  47.86 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.51 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.8 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  42.11 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  47.47 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.02 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.28 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.76 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.47 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  45.55 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.43 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  46.56 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.31 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.31 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.11 
 
 		 539 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>