85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0618 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  100 
 
 		 820 aa  1667    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  31.92 
 
 		 878 aa  364  4e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  30.08 
 
 		 867 aa  362  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  29.57 
 
 		 863 aa  362  2e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  28.87 
 
 		 868 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 903 aa  273  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 871 aa  248  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 868 aa  228  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  24.55 
 
 		 919 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  23.11 
 
 		 862 aa  217  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  23.73 
 
 		 843 aa  214  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  25.25 
 
 		 895 aa  211  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  26.44 
 
 		 612 aa  203  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  26.11 
 
 		 701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  25.98 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 632 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 489 aa  55.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 		 503 aa  54.3  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 506 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 501 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.04 
 
 		 511 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 492 aa  51.6  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 		 499 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 495 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 507 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.6 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.41 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 504 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 		 497 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 504 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 542 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 492 aa  50.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.4 
 
 		 545 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.6 
 
 		 492 aa  49.3  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.41 
 
 		 511 aa  49.3  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.28 
 
 		 508 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  21.98 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 509 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 587 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 558 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 518 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 513 aa  48.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.17 
 
 		 516 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.02 
 
 		 520 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 504 aa  47.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 584 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 		 519 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 537 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 		 514 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.3 
 
 		 589 aa  47.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 558 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 580 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.03 
 
 		 510 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 507 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 587 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 1437 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  28.21 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.98 
 
 		 511 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 524 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 511 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 497 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  20.33 
 
 		 566 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 542 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  21.23 
 
 		 540 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.85 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 607 aa  45.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.98 
 
 		 511 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 528 aa  45.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 533 aa  45.8  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 522 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 517 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 508 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 		 496 aa  45.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  19.06 
 
 		 606 aa  45.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 496 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.85 
 
 		 551 aa  44.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 594 aa  44.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1014  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 		 523 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  25.56 
 
 		 546 aa  44.3  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  35.85 
 
 		 514 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 511 aa  44.3  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 618 aa  44.3  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 532 aa  44.3  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>