209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3246 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  93.22 
 
 		 300 aa  557  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  82.37 
 
 		 295 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  74.15 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  70.31 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  71.96 
 
 		 299 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  69.9 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  70.24 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  69.9 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 		 303 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  68.37 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  70.65 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  67.92 
 
 		 304 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  69.97 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  66.22 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  69.44 
 
 		 304 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  69.55 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  67.23 
 
 		 303 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  70.79 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  69.66 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  64.51 
 
 		 318 aa  384  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  62.67 
 
 		 301 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 298 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 300 aa  358  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  56.46 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  53.47 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  54.39 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  53.47 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  54.39 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  54.33 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  51.36 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  56.16 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  53.8 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  53.14 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  53.24 
 
 		 286 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  52.68 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 284 aa  264  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  43.14 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  42.61 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  41.58 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  39.56 
 
 		 348 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 345 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 344 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  39.56 
 
 		 347 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  37.97 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  44.13 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  37.66 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 362 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  40.63 
 
 		 362 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  40.69 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  39.93 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  39.18 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  40.48 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  39.38 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 307 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  38.61 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  38.61 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  40.34 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  38.98 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  39.66 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 		 375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  47.41 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.34 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  42.55 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  37.74 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  42.41 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  40.34 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>