117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2540 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2540  signal-transduction protein  100 
 
 		 136 aa  282  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  49.18 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3019  signal-transduction protein  54.1 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  24.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  27.35 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  26.72 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  25.64 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.72 
 
 		 261 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.21 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  25.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  30 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  29.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  27.03 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  23.93 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  27.83 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  23.21 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  25 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  27.5 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  28.7 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  27.08 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  31.9 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  27.43 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  27.27 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  25.96 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  24.14 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 		 625 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.49 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.36 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  27.97 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  27.55 
 
 		 334 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  25.83 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  31 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  25.29 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  30.21 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  23.96 
 
 		 513 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.31 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  24.14 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  23.73 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3740  KpsF/GutQ family protein  28.41 
 
 		 391 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  33.73 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  24.14 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  30.21 
 
 		 503 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  25.77 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  21.67 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  24.14 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  24.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  23.77 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 		 490 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.75 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.21 
 
 		 502 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  23.96 
 
 		 513 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  25.26 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  29.55 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  26.04 
 
 		 502 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  27 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  24.14 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.31 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  31.03 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  30.95 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  24.56 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  26.81 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.04 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  24.74 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.44 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  23.68 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  26.21 
 
 		 146 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 231 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 704 aa  41.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  33.73 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  25 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4187  KpsF/GutQ family protein  31.4 
 
 		 348 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  30 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4212  KpsF/GutQ family protein  31.4 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  24.74 
 
 		 488 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  23.13 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 		 688 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  24.53 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>