71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2265 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  68.65 
 
 		 512 aa  692    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  70 
 
 		 522 aa  710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  78.3 
 
 		 497 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  71.76 
 
 		 502 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  100 
 
 		 506 aa  1010    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  56.45 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  56.31 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  56.14 
 
 		 519 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  55.32 
 
 		 521 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  52.17 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  52.01 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  51.84 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  51.05 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  51.74 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  52.22 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  52.28 
 
 		 495 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  50.96 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  50.3 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  50.76 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  50.38 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  33.15 
 
 		 522 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  32.73 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  34.86 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  32.8 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  33.54 
 
 		 491 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  33.97 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  31.41 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  29.09 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  28.62 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  28.62 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  32.75 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  30.66 
 
 		 561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  30.21 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  30.14 
 
 		 559 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  29.12 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  31.31 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  31.85 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  28.8 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  30.7 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  30.7 
 
 		 560 aa  153  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  30.37 
 
 		 554 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  30.35 
 
 		 554 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  29.64 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  28.35 
 
 		 565 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  27.87 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  28.17 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  27.13 
 
 		 386 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  33.45 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  31.54 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  33.46 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  30.86 
 
 		 372 aa  93.6  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  33.46 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  37.5 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  35.38 
 
 		 391 aa  90.9  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  35.9 
 
 		 367 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  32.07 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  31.4 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  29.45 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  35.92 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  37.65 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  32.65 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  29.33 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  34.12 
 
 		 338 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  36.47 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  36.47 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  22.92 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  34.12 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  34.12 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  32.94 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  24.39 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  22.77 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>