More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4433 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  51.5 
 
 
308 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  50.58 
 
 
264 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 
261 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  43.13 
 
 
266 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.93 
 
 
268 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 
265 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 
284 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
271 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  37.55 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.68 
 
 
260 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
259 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.85 
 
 
294 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  34.05 
 
 
292 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.24 
 
 
264 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 
260 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 
260 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
282 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
250 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  36.21 
 
 
263 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.07 
 
 
264 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
277 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
275 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
275 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
279 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  35.12 
 
 
425 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.74 
 
 
262 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.62 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  35.69 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.66 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  25.68 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.17 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.44 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.94 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.46 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.78 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
270 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
287 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 
263 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  33.18 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  32.81 
 
 
387 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.88 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  37.92 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
387 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  34.13 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  31.44 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.64 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  29.64 
 
 
286 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
281 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  32.42 
 
 
387 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  29.41 
 
 
272 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
299 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  34.02 
 
 
265 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>