More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4420 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  100 
 
 
440 aa  861    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  46.52 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  39.74 
 
 
471 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  35.52 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  36.71 
 
 
452 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  35.98 
 
 
424 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  34.03 
 
 
410 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  35.49 
 
 
454 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  36.75 
 
 
406 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  36.64 
 
 
426 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  36.76 
 
 
421 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  34.36 
 
 
414 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  36.64 
 
 
488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  34.38 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  34.92 
 
 
500 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  34.35 
 
 
437 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  33.71 
 
 
465 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.43 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.1 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  29.23 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.48 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  27.6 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  30.11 
 
 
412 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  29.59 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  32.42 
 
 
408 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.72 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  31.65 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  27.59 
 
 
409 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  30.05 
 
 
401 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  26.05 
 
 
416 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.82 
 
 
411 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.86 
 
 
412 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  29.63 
 
 
409 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  29.59 
 
 
424 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  30.89 
 
 
417 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.12 
 
 
420 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  29.76 
 
 
367 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  27.59 
 
 
426 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  30.03 
 
 
373 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  30.52 
 
 
398 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.07 
 
 
398 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.84 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  28.22 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  27.82 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  29.11 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  25.43 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  28.19 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  33.76 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.12 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  29.51 
 
 
407 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  27.59 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  28.91 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  24.57 
 
 
411 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  29 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  29.15 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  29.6 
 
 
366 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  24.19 
 
 
411 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  29.01 
 
 
408 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  28.08 
 
 
420 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  28.92 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  29.48 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  25.37 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  25.37 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  25.12 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.03 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.12 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  29.55 
 
 
400 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  27.43 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.12 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  26.99 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.12 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  28.64 
 
 
412 aa  87  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  28.03 
 
 
399 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  24.33 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  26.8 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  27.63 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  30.1 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  31.6 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  29.26 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  29.04 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  30.79 
 
 
376 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  28.89 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  23.88 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  30.73 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  27.3 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  27.3 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  28.05 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  27.24 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  27.93 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  27.24 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  27.3 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  27.8 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  29.04 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  22.92 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  26.82 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  26.25 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  28.87 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  28.43 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  26.89 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  27.24 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>