More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3987 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  64.65 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  63.16 
 
 		 201 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  63.73 
 
 		 198 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  61.09 
 
 		 206 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  63.24 
 
 		 209 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  63.59 
 
 		 197 aa  241  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  64.52 
 
 		 189 aa  234  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  59.59 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  56.45 
 
 		 196 aa  224  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  61.5 
 
 		 199 aa  218  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  56.19 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  57.81 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  57.29 
 
 		 194 aa  198  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  59.07 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  55.61 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  55.08 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  55.08 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  55.08 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  58.55 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  56.22 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  56.85 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  54.69 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  52.55 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  59.36 
 
 		 194 aa  187  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  56.68 
 
 		 195 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 188 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  56.44 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  54.5 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 188 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  55.05 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 187 aa  161  9e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  51.11 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  51.11 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 185 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 192 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 201 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  39.33 
 
 		 179 aa  141  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 195 aa  141  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 196 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  39.11 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  47.78 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  35.83 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  43.33 
 
 		 193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 202 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  45.39 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.36 
 
 		 189 aa  134  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  42.04 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>