129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3470 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3470  Protein of unknown function DUF2260  100 
 
 
333 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  37.54 
 
 
324 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  38.41 
 
 
337 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  37.77 
 
 
766 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  34.34 
 
 
339 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  35.35 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  33.64 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  40.2 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  39.07 
 
 
321 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  39.07 
 
 
321 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  39.07 
 
 
321 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  37.79 
 
 
321 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  38.21 
 
 
320 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  34.83 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  34.83 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  38.82 
 
 
319 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  39.93 
 
 
322 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  40.68 
 
 
328 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  34.77 
 
 
325 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  36.91 
 
 
321 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  38.03 
 
 
332 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  39.34 
 
 
326 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  38.93 
 
 
319 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  38.18 
 
 
330 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.78 
 
 
323 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  37.83 
 
 
318 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  38.82 
 
 
324 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  36.33 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  37.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  36.22 
 
 
326 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  36.12 
 
 
326 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  34.2 
 
 
359 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  33.78 
 
 
348 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  36.84 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  34.54 
 
 
341 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  38.43 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  34.26 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  35.63 
 
 
328 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  37.46 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  34.59 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  34.5 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  34.22 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  32.54 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  36.27 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  35.45 
 
 
310 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  35.97 
 
 
327 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  30.67 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  37.8 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  37.8 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  37.8 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  32.26 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  33.88 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  31.85 
 
 
723 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  33.13 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  34.14 
 
 
334 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  34.77 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  33.74 
 
 
325 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  32.79 
 
 
329 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  33.77 
 
 
325 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  35.12 
 
 
310 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  35.41 
 
 
324 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  35.89 
 
 
330 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  30.65 
 
 
318 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  34.54 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  32.81 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  36.55 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  34.85 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  31.86 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  35.62 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  32.73 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  31.89 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  34.22 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  29.76 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  32.78 
 
 
320 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  30.06 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  35.62 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  35.62 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  28.9 
 
 
325 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  34.97 
 
 
337 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  34.97 
 
 
337 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  34.31 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  33.22 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1582  hypothetical protein  33.09 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  28.09 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  27.44 
 
 
318 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  32.13 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  33.45 
 
 
373 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  34.11 
 
 
323 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  29.04 
 
 
342 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  33.44 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  34.97 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  33.44 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  30.06 
 
 
326 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  33.56 
 
 
348 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  29.97 
 
 
326 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  26.3 
 
 
334 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11095  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  27.56 
 
 
314 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>