More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2874 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  69.76 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  62.91 
 
 		 221 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  62.09 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  59.72 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  60.09 
 
 		 222 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  56.31 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  61.5 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  56.31 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  57.07 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  58.33 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  55.67 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  60.29 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  55.61 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  56.28 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  52.45 
 
 		 221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  56.59 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  53.05 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  52.68 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  55.12 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  55.61 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  51.22 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  50.98 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  51.71 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  50.95 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  50.47 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  50.73 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  52.5 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  52.5 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  52.5 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  53.2 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  50.93 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 		 214 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  39.61 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  37.96 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.49 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  43.51 
 
 		 137 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  41.48 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  34.05 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  43.08 
 
 		 134 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  43.08 
 
 		 134 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.51 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  42.31 
 
 		 134 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  39.23 
 
 		 134 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  32.24 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  37.61 
 
 		 138 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 143 aa  86.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.07 
 
 		 143 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 		 141 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  23.14 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.85 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  41.51 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  31.79 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  24.46 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  24.31 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  32.86 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 459 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28.57 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  34.13 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  39.39 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  31.85 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.9 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.9 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  31.05 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 458 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.86 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  25.82 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.29 
 
 		 469 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  40.4 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>