212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1893 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 285 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  45.85 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  46.98 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  43.56 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  42.24 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  41.06 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  42.75 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  40.52 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  42.96 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  40.23 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  38.69 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1345  helix-turn-helix domain protein  59.41 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  41.4 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  42.01 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 299 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  45.45 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.2 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  40.77 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  39.15 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  37.96 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  41.85 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  38.06 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  39 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  39.69 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.35 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  36.86 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  37.59 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  38.24 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  37.18 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  37.54 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  38.65 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.46 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  40.69 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  39.43 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  41.26 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.54 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  40.23 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  35.86 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.13 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.77 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.68 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.19 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>