More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1744 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
436 aa  836    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
512 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  37.22 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  33.57 
 
 
427 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
420 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.97 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
433 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.07 
 
 
405 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.07 
 
 
405 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  31.76 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.46 
 
 
426 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
442 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  29.53 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.32 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.33 
 
 
413 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.57 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  29.95 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.26 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  28.92 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.95 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.3 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  29.05 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.91 
 
 
209 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.75 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  29.86 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.79 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.67 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.79 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.72 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.67 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.45 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.15 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.72 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.67 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.67 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.12 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.14 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.16 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.78 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.16 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.45 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  24.61 
 
 
549 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.41 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.35 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.63 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.52 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  32.5 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.07 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  30.77 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  29.44 
 
 
551 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  27.03 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.07 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.82 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  25.48 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  23.93 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.49 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  22.97 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.54 
 
 
535 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.47 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  26.5 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.15 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  28.1 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  28.57 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  28.57 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.92 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  28.57 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  28.57 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  27.45 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30.43 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  24.6 
 
 
454 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>