More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1742 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 430 aa  879    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  52.26 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  53.99 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  49.17 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  43.59 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 611 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  32.32 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 437 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 403 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.48 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.64 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.4 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  30.92 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.22 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  28.04 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  29.75 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  30.56 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.55 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  29.93 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  29.05 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  29.1 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  30.33 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  28.75 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  29.05 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  30.05 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  28.25 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  28.5 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  28.5 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  29.93 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  29.01 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  28.97 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  29.75 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  29.75 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  29.75 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  29.75 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  29.75 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  29.75 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  29.88 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  29.97 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  30.22 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 399 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  28.78 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>