More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0890 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  60.03 
 
 		 653 aa  726    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 655 aa  1301    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.83 
 
 		 702 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  45.63 
 
 		 727 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.3 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  44.27 
 
 		 638 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  41.8 
 
 		 670 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  41.76 
 
 		 839 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.59 
 
 		 607 aa  415  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.93 
 
 		 754 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.27 
 
 		 663 aa  405  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.44 
 
 		 635 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.75 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  40 
 
 		 716 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 		 586 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.45 
 
 		 579 aa  360  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 		 677 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.79 
 
 		 637 aa  342  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.33 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  38.09 
 
 		 716 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.11 
 
 		 657 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 657 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.3 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 635 aa  313  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 642 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 642 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 642 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.31 
 
 		 656 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 662 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 634 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 657 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 654 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 631 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.87 
 
 		 622 aa  296  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 729 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.28 
 
 		 600 aa  296  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 		 570 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 657 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  33.18 
 
 		 679 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 586 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 		 619 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 		 556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 613 aa  290  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 654 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.38 
 
 		 708 aa  286  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.33 
 
 		 695 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 		 689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 690 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 654 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.45 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.51 
 
 		 703 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  34.05 
 
 		 553 aa  280  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.87 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.88 
 
 		 583 aa  277  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 		 708 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 553 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.93 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 576 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 		 578 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.46 
 
 		 740 aa  273  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 595 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 575 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.96 
 
 		 605 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  32.87 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  32.29 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.36 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 583 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.13 
 
 		 552 aa  271  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 614 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.13 
 
 		 548 aa  270  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 580 aa  270  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 705 aa  270  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  34.05 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.53 
 
 		 660 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  33.22 
 
 		 711 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.75 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  33.92 
 
 		 607 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  32.93 
 
 		 582 aa  267  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 582 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 645 aa  266  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 671 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.33 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 672 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>