More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0642 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  63.33 
 
 		 222 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  55.71 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  55.61 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  46.5 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.48 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.61 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.22 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  46.79 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.53 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  39.86 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  33.61 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.78 
 
 		 1287 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  32.59 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  29.61 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.67 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.23 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.35 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  32.79 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.14 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.14 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.77 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  32.67 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.94 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  42.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  33.64 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  42.62 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  36.54 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.56 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.53 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  24 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  35.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.52 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.21 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>