More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5231 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  59.06 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  55.52 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  46.46 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  45.51 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  45.91 
 
 		 362 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  52.4 
 
 		 371 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  44.65 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  45.6 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  43.67 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  54.44 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  42.59 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  53.31 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  40.71 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  40.57 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  31.23 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  37.39 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  34.74 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  41.51 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.1 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.54 
 
 		 452 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.63 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.58 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.83 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  38.18 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  30.7 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  29.86 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.6 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.24 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.1 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  37.76 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  40.75 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.04 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  39.33 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  32.41 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  33.9 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  42.14 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  37.67 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  30.46 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.53 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  34.2 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  33.44 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  35.67 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  34.56 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  41.24 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  36.44 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.24 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  33.33 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  33.44 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.77 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.56 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.39 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  29.82 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  38.74 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  35.33 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  36.36 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  33.83 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  31.07 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  32.56 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  36 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.58 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.42 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.89 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  31.09 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  31.43 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  36.55 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.01 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  36.34 
 
 		 371 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  40.55 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  38.97 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  35.28 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  40.61 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  36.89 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  31.97 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  30.57 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.53 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  34.48 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  30.85 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  34.48 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  34.48 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  37.39 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  37.73 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  41.58 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  36.23 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 356 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  34.9 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35.86 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  37.61 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  35.82 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.29 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  35.55 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.35 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  36.84 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>