More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3884 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 497 aa  981    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  56.79 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  54.64 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  35.91 
 
 		 522 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.86 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 505 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  37.19 
 
 		 530 aa  229  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 553 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  35.7 
 
 		 522 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 522 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 522 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 522 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 522 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 522 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.01 
 
 		 527 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.44 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 531 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 531 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 529 aa  200  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 523 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  32.22 
 
 		 1528 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  32.22 
 
 		 1520 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  32.22 
 
 		 1483 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  32.22 
 
 		 1483 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 535 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 535 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 535 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 535 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 691 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.83 
 
 		 3291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.83 
 
 		 3348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.91 
 
 		 6006 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  30.91 
 
 		 526 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 893 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 512 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 521 aa  180  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.03 
 
 		 539 aa  180  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  31.59 
 
 		 1346 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 531 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.51 
 
 		 508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 		 542 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 511 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 523 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 517 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  31.08 
 
 		 3761 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.82 
 
 		 6676 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.12 
 
 		 512 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  32.02 
 
 		 1332 aa  170  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 770 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  29.01 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  29.67 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 		 5328 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>