More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3112 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  68.63 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  65.68 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  66.91 
 
 		 274 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  65.44 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  68.75 
 
 		 271 aa  333  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  66.79 
 
 		 274 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  66.79 
 
 		 274 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  66.79 
 
 		 274 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  65.31 
 
 		 271 aa  321  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  64.94 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  60.44 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  59.49 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  57.72 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  58.27 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  55.93 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  56.99 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  54.96 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  57.2 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  53.76 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  52.5 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  49.64 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  48.55 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  52.31 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  50.55 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.03 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 278 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.31 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  47.67 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  48.57 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 273 aa  208  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  47.1 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.2 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.01 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 296 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.99 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  41.84 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.28 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.18 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.58 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.11 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.36 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  39.65 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  40.7 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  39.16 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.82 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  41.37 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  40.62 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  42.65 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.65 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  41.28 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.14 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  39.72 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  36.88 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>