More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3057 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  100 
 
 		 334 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  75.15 
 
 		 333 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  78.29 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  80 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  78.15 
 
 		 275 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  78.15 
 
 		 275 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  78.15 
 
 		 275 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  71.32 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  63.57 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  66.42 
 
 		 294 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  63.23 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  63.53 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  62.6 
 
 		 271 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  61.15 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  59.77 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  59.11 
 
 		 258 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.49 
 
 		 258 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  54.76 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  58.06 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  56.97 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  55.56 
 
 		 255 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  57.49 
 
 		 258 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  57.49 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  56.52 
 
 		 256 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 260 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  55.2 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  55.82 
 
 		 264 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.42 
 
 		 265 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  57.26 
 
 		 257 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  55.2 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  55.2 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  54.4 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 		 258 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  53.23 
 
 		 256 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  53.6 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  55.16 
 
 		 255 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  55.6 
 
 		 264 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  56.35 
 
 		 265 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  56.35 
 
 		 265 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  57.49 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  57.49 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  56.68 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  51.98 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  53.57 
 
 		 256 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  56.35 
 
 		 253 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  55 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.68 
 
 		 257 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  56.45 
 
 		 270 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 		 270 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 259 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  53.7 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  53.1 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  53.52 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 		 270 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 		 254 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  52.78 
 
 		 255 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.57 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.98 
 
 		 255 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.82 
 
 		 259 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 260 aa  262  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  51 
 
 		 257 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  52.76 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  54.44 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  50.59 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.21 
 
 		 254 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50.37 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51.81 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  51.1 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.78 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.1 
 
 		 261 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  52.02 
 
 		 250 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  52.82 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  50.81 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 252 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50.59 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.98 
 
 		 268 aa  255  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  51.55 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  54.66 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>