43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1685 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  100 
 
 		 166 aa  320  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  61.33 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  51.09 
 
 		 188 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  50 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  42.95 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  46.81 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  50.96 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  49.04 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  49.28 
 
 		 228 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  52.21 
 
 		 228 aa  97.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  45.33 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  40 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  49.48 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  41.48 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  38.46 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  39.67 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  38.41 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  41.18 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  43.44 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  34.31 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  32.12 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  32.09 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.59 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  39.52 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  38.28 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  33.1 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  35 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  39.51 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  37.63 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.78 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  38.4 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  35.21 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  29.75 
 
 		 362 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  29.1 
 
 		 360 aa  44.3  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  25.18 
 
 		 364 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  22.73 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  23.08 
 
 		 297 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  29.63 
 
 		 430 aa  41.6  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  23.44 
 
 		 373 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  27.66 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>