More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1142 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 		 147 aa  216  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  75.86 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  73.1 
 
 		 147 aa  209  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  74.48 
 
 		 152 aa  208  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  75.17 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  72.73 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  70.07 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  68.53 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  70.34 
 
 		 164 aa  196  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  68.28 
 
 		 162 aa  193  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 243 aa  191  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 163 aa  190  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  68.53 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  70.63 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  67.59 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 147 aa  186  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  66.9 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  67.61 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  65.52 
 
 		 210 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  63.45 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  65.28 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  63.89 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  63.89 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  63.89 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  61.11 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  67.83 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  67.13 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  56.78 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  48.63 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  42 
 
 		 174 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  42.07 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  41.38 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  47.02 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  40 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  41.67 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 172 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 161 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  41.83 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.98 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 171 aa  93.6  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  46.31 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 		 169 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  38.36 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>