56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_11981 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  98.36 
 
 
305 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  61.97 
 
 
305 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  48.68 
 
 
307 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  43.71 
 
 
304 aa  222  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  41.69 
 
 
290 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  37.8 
 
 
261 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  38.59 
 
 
261 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  38.93 
 
 
261 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  38.43 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.7 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  26.52 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.43 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  21.88 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.06 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  24.23 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.8 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.94 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.77 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.56 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.4 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.5 
 
 
313 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.21 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.85 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.85 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  23.91 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.86 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.53 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.95 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  35.44 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  34 
 
 
312 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.81 
 
 
291 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 
320 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  23.1 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  20.29 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  22.74 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.79 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  23.22 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  21.8 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  22 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.4 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  21.88 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.61 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  27.55 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.02 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.24 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  25.45 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>