51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4435 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  55.67 
 
 
875 aa  758    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  74.46 
 
 
883 aa  1130    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  61.13 
 
 
877 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  100 
 
 
885 aa  1705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  61.02 
 
 
877 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  61.02 
 
 
877 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  40.7 
 
 
1051 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  47.73 
 
 
877 aa  161  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  26.57 
 
 
880 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  42.39 
 
 
874 aa  142  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  27.84 
 
 
892 aa  109  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.21 
 
 
873 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  37.5 
 
 
946 aa  82.8  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  23.89 
 
 
875 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  32.8 
 
 
901 aa  78.2  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  33.76 
 
 
910 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  26.14 
 
 
881 aa  67.8  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  29.43 
 
 
870 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.21 
 
 
880 aa  65.1  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 
880 aa  64.3  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  32.48 
 
 
875 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  39.77 
 
 
917 aa  62.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  38.96 
 
 
888 aa  60.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  29.4 
 
 
878 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  36.08 
 
 
821 aa  59.3  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  30.53 
 
 
918 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  34.78 
 
 
711 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  33.04 
 
 
875 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  39.34 
 
 
1157 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  43.18 
 
 
978 aa  48.9  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  36.05 
 
 
1167 aa  48.5  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  32.85 
 
 
1282 aa  48.5  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  47.92 
 
 
852 aa  48.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  47.92 
 
 
852 aa  48.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  31.31 
 
 
1137 aa  47.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.8 
 
 
634 aa  48.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  30.19 
 
 
1080 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  25.1 
 
 
878 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  40 
 
 
1126 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  27.37 
 
 
874 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  40 
 
 
1126 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  39.62 
 
 
579 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  37.14 
 
 
1351 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.57 
 
 
1194 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  34.85 
 
 
830 aa  45.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  37.78 
 
 
1158 aa  45.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  40.32 
 
 
1153 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  39.02 
 
 
1127 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.59 
 
 
723 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  26.72 
 
 
1227 aa  44.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  36.36 
 
 
581 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>