91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2582 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  81.58 
 
 
110 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  73.68 
 
 
115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  46.3 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  35.09 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  40.85 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  46.38 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  43.06 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  42.25 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  45.59 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  41.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  32.39 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  40.26 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  35.38 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  35.94 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  35.94 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  33.66 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  35.94 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  35.38 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  31.34 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  36 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  32.89 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  29.49 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  31.08 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  28 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  29.49 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  38.46 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0769  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000195822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  25 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  34.02 
 
 
155 aa  42  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  31.17 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  30.77 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  29.82 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  25.88 
 
 
93 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 
109 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  39.13 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  38.18 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  28.12 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  28.12 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  28.12 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  29.49 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.55 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  31.51 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  31.51 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 
106 aa  40  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 
120 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>