More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1861 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85 
 
 
273 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.48 
 
 
263 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.48 
 
 
263 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.86 
 
 
263 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609923  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
246 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.52 
 
 
246 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.13 
 
 
246 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.34 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
252 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  38.98 
 
 
247 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 
250 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
255 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
255 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.98 
 
 
246 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  38.19 
 
 
247 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 
239 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  37.36 
 
 
271 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
253 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
254 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
282 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.9 
 
 
246 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.47 
 
 
256 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
247 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
261 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
244 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
246 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
240 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
245 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
258 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
255 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.72 
 
 
246 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
244 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.61 
 
 
246 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
281 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
256 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
256 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
245 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
257 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
269 aa  149  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
251 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
257 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
257 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
247 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
250 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
260 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
247 aa  148  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
256 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
250 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5524  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
257 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
248 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
267 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
263 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
268 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  36.96 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
263 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
248 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
263 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>