260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1130 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1130  patatin  100 
 
 		 341 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  48.08 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  44.62 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.42 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  40.31 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  35.56 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  35.56 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  35.74 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  35.74 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  35.74 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  35.74 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  35.74 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  34.65 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  34.35 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  34.94 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  32.81 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  32.7 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  25.73 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  27.27 
 
 		 520 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  23.92 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  25.56 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  24.84 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  25.27 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  30.99 
 
 		 540 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  25.43 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  30.7 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  29.78 
 
 		 586 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  28.5 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  31.88 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  32.63 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.86 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  28.17 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.11 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  23.1 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.17 
 
 		 728 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.24 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.24 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.24 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.96 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.78 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  25.32 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.44 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.44 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  25.62 
 
 		 923 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  23.27 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.1 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.26 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.19 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.19 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  27.08 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  28.83 
 
 		 775 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  26.76 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.47 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  26.67 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  29.54 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  26.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  26.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  29.07 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.11 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  26.77 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  29.49 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.18 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  29.49 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.56 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  27.31 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  23.64 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.56 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.31 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  27.35 
 
 		 981 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.11 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.57 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.64 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  25.44 
 
 		 728 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  26.79 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.44 
 
 		 751 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  29.33 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  26.48 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.7 
 
 		 760 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.14 
 
 		 728 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.11 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  29.6 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.11 
 
 		 748 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  26.83 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  26.21 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.5 
 
 		 741 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  24.64 
 
 		 909 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25 
 
 		 740 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.28 
 
 		 738 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.93 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  30.94 
 
 		 771 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1065 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 583 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.23 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27.92 
 
 		 728 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.27 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  29.13 
 
 		 738 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.67 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>