66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2373 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  71.88 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  67.74 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  62 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  62.63 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  62.63 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  60.61 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  62.89 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  57.45 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  59.6 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  69.74 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  61.7 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  56.86 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  59.57 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  53 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  51 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  49.38 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  41.41 
 
 		 1556 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  41.94 
 
 		 466 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  41.18 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  50.75 
 
 		 406 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  41.94 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1381 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1541 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  46.81 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  42.55 
 
 		 540 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  41.18 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  38.3 
 
 		 481 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  43.66 
 
 		 1386 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37.78 
 
 		 1422 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  35.48 
 
 		 469 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  40.43 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  44.29 
 
 		 1421 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  40.43 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  38.04 
 
 		 386 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.89 
 
 		 592 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  44.09 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  36.96 
 
 		 379 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  36.17 
 
 		 181 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  43.94 
 
 		 1229 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  41.43 
 
 		 1446 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  40.62 
 
 		 1447 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  39.06 
 
 		 1428 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 1553 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  37.97 
 
 		 386 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  44.93 
 
 		 1140 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  36.56 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  36.56 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1411 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 456 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.94 
 
 		 855 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>